云南2株基因Ⅱ型新城疫病毒F基因变异特性分析

对云南省2个发病鸡场的组织病料进行病原分离，通过血凝、血凝抑制试验和RT-PCR检测，证明分离毒株为新城疫病毒（Newcastle disease virus, NDV）。采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因，纯化后克隆至pMD18-T载体，并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明，分离获得的云南省2株 NDV毒株F基因核苷酸与La Sota株的核苷酸同源性为99.4%～99.6%，与国内外分离的流行毒株SP13和NDV027344核苷酸同源性均为99.7%～99.8%，与F48E9株的核苷酸同源性为89.0%～89.1%；F蛋白氨基酸与La Sota株的氨基酸同源性为99.3%～99.5%，与流行毒株SP13和NDV027344的氨基酸同源性均为99.5%～99.6%，与F48E9株的氨基酸同源性为91.8%～92.0%。系统发育分析结果表明，2株病毒均属于基因Ⅱ型，裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L，属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征。