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| 奥利亚罗非鱼3种C型溶菌酶基因的克隆及其序列分析 | |
| 引用本文： | 禹绍国,叶星,张莉莉,田园园,劳海华,白俊杰,卢迈新.奥利亚罗非鱼3种C型溶菌酶基因的克隆及其序列分析[J].农业生物技术学报,2010,18(1):66-74. |
| 作者姓名： | 禹绍国 叶星 张莉莉 田园园 劳海华 白俊杰 卢迈新 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380;上海海洋大学,上海,201306 2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380 3. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州,510380;广东海洋大学,湛江,524025 |
| 基金项目： | 国家科技支撑计划，广东省农业攻关项目，广东省农业科技重大专项，广东省重大科技兴渔项目，广东省农业领域重点项目，农业部948项目 |
| 摘 要： | 本研究结合RT-PCR和RACE法获得了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)三种C型溶菌酶基因C-1,-2和C-3的全长cDNA.3个基因的cDNA分别为581 bp、662 bp和695 bp,各编码143、156和143个氨基酸(GenBank accession No:EU913095,EU913094和EU836689),相互间氨基酸序列的同源性在63.9%~67.8%之间.3个基因均具有与其它物种C型溶菌酶相同的8个保守半胱氨酸残基和2个活性位点Glu~(35)和Asp~(52),可认为它们均为C型溶菌酶基因.在系统进化树中这3个基因首先与同属高等真骨鱼类的聚类,最后再与低等真骨鱼类的聚类,系统进化关系与传统鱼类分类地位相吻合,显示真骨鱼类C型溶菌酶的进化速度与物种的进化速度基本一致.蛋白分析软件分析显示这3个基因均具有C型溶菌酶的典型结构、相似的蛋白二、三级结构,推测应具有与C型溶菌酶相似的生理功能.但3个基因氨基酸序列间存在一定差异,其中C-1的等电点较低且碱性氨基酸较少,因此3种溶菌酶可能具有生理功能上的差异与分工. |
| 关 键 词： | 奥利亚罗非鱼 C型溶菌酶 蛋白质高级结构 |
Molecular Cloning and Sequencing of Three C-Type Lysozyme Genes from Oreochromis aureus |
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| Yu Shaoguo , Ye Xing Zhang Lili , Tian Yuanyuan Lao Haihua Bai Junjie Lu Maixin Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fisheries Sciences,Guangzhou, Shanghai Ocean University,Shanghai, Guangdong Ocean University,Zhanjiang.Molecular Cloning and Sequencing of Three C-Type Lysozyme Genes from Oreochromis aureus[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2010,18(1):66-74. | |
| Authors: | Yu Shaoguo Ye Xing Zhang Lili Tian Yuanyuan Lao Haihua Bai Junjie Lu Maixin Pearl River Fisheries Research Institute Chinese Academy of Fisheries Sciences Guangzhou Shanghai Ocean University Shanghai Guangdong Ocean University Zhanjiang |
| Institution: | Yu Shaoguo 1,2 Ye Xing 1* Zhang Lili 1,3 Tian Yuanyuan 1 Lao Haihua 1 Bai Junjie 1 Lu Maixin 1 1 Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fisheries Sciences,Guangzhou,510380,2 Shanghai Ocean University,Shanghai,201306,3 Guangdong Ocean University,Zhanjiang,524025 |
| Abstract: | Total RNA was isolated from livers of Oreochromis aureus and three chicken-type(C-type) lysozyme cDNAs,C-1,C-2 and C-3 were obtained by RT-PCR and RACE methods(GenBank accession No.:EU913095,EU913094 and EU836689).The whole cDNA length of C-1 was 581 bp,consisting of a 432 bp open reading frame(ORF) which encoded 143 amino acids.The C-2 cDNA was 662 bp in length,consisting of a 471 bp ORF which encoded 156 amino acids.The C-3 cDNA was 695 bp,consisting of a 432 bp ORF which encoded 143 amino acids.The amino... |
| Keywords: | Oreochromis aureus C-type lysozyme protein tertiary structucture prediction |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ | |