一种绿豆柱头外露突变体的转录组分析 |
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引用本文: | 宋梦媛,郭中校,苏禹霏,邓昆鹏,兰天娇,程钰鑫,包淑英,王桂芳,窦金光,姜泽锴,王明海,徐宁.一种绿豆柱头外露突变体的转录组分析[J].作物学报,2024(4):957-968. |
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作者姓名: | 宋梦媛 郭中校 苏禹霏 邓昆鹏 兰天娇 程钰鑫 包淑英 王桂芳 窦金光 姜泽锴 王明海 徐宁 |
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作者单位: | 1. 吉林省农业科学院作物资源研究所/作物种质资源吉林省实验室;2. 吉林农业大学农学院 |
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基金项目: | 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08-Z8)资助~~; |
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摘 要: | 柱头外露作为提高作物异交率、制种纯度和降低制种成本的优良性状,在杂交制种中得到了广泛的利用。绿豆是一种闭花授粉的作物,被报道的柱头外露突变体很少。通过对冀绿7号的化学诱变,发现了1个柱头外露突变体se2,为明确该突变体柱头外露的分子机制,对该突变体及其野生型冀绿7号即将开放的花蕾进行了转录组测序(RNA-seq)分析。根据差异倍数|log2(Fold Change)|≥1,P≤0.05的标准筛选,在se2中共得到572个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),其中262个DEGs上调, 310个DEGs下调。在基因本体(gene ontology, GO)数据库中,差异表达基因显著富集到代谢和生物合成等生物过程,定位在质外体和细胞壁、细胞膜等区域,与结合、氧化还原等分子功能有关。在京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genome, KEGG)数据库中,差异表达基因显著富集在植物激素信号传导、次生代谢物生物合成等通路。功能注释发现许多有关细胞壁合成和代谢、细胞分裂...
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关 键 词: | 绿豆 柱头外露 突变体 转录组 高通量测序 杂种优势 |
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