| 小麦TaPOD家族的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 琚吉浩,马超,王添宁,吴毅,董钟,方美娥,陈钰姝,张均,付国占.小麦TaPOD家族的全基因组鉴定及表达分析[J].作物学报,2024(3):779-821. |
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| 作者姓名： | 琚吉浩 马超 王添宁 吴毅 董钟 方美娥 陈钰姝 张均 付国占 |
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| 作者单位： | 1. 河南科技大学农学院;2. 河南科技大学食品与生物工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32372227,31401323)；;河南省自然科学基金项目(222300420430)；;河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2021GGJS050)； |
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| 摘 要： | 过氧化物酶(Peroxidase, POD)家族成员在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中起重要作用。为系统探究小麦(TriticumaestivumL.)TaPOD基因家族的功能及其表达模式,本研究利用生物信息学的方法鉴定了小麦TaPOD基因家族成员,对其理化性质、启动子顺式作用元件、进化特征做了预测分析,并通过小麦转录组和实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative, RT-qPCR)分析了其在不同组织、外源激素及逆境胁迫下的表达模式。结果表明,目前基因组测序小麦中包含659个TaPOD基因家族成员,蛋白质序列长度在206～518个氨基酸之间;系统发育分析表明,小麦TaPOD家族成员分为I～VII组且每组成员数量不等;序列比对显示小麦TaPOD家族成员具有5个保守基序,且基因结构等方面存在很大差异,预示着功能存在多样性;染色体定位发现其数量在小麦的21条染色体上分布不均匀,其中2B染色体上数量最多;通过种内共线性分析发现,小麦TaPOD基因共有396个重复事件,同源性较高且进化过程非常保守,主要通过片段复制和串联复制进行扩增,且Ka/Ks比率显示仅有4对家族成员受到...
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| 关 键 词： | 小麦 TaPOD基因家族 生物信息学 共线性分析 基因表达 |
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