油橄榄PLATZ基因家族的鉴定及表达模式

PLATZ是植物中发现的一类锌指类转录因子，对于调控植物的基因表达具有重要作用。为明确油橄榄中PLATZ基因家族成员的特征，本研究对油橄榄PLATZ基因家族进行了鉴定与分析。结果表明：在油橄榄中共鉴定到29个PLATZ基因家族成员(OePLATZs)；不同OePLATZs基因之间结构较为保守；染色体定位表明基因在染色体中分布比较分散，亚细胞定位结果显示其中28个OePLATZs蛋白质定位在细胞核中，而OePLATZ3蛋白质定位在线粒体中；结构预测发现二级结构中具有较大比例的无规则卷曲，三级结构中29个OePLATZs蛋白质在基序Ⅰ处多有α-螺旋的存在，在基序Ⅱ处多为是无规则卷曲；根据基因差异表达结果可将OePLATZs基因在不同组织中的表达模式分为8类，并根据干旱胁迫条件下树枝组织的转录组数据，鉴定了发生上调和下调的OePLATZs基因；系统发育分析发现油橄榄和拟南芥的PLATZ基因家族成员之间有较近的亲缘关系。本研究初步鉴定并分析了油橄榄的PLATZ基因家族成员的特征与功能，为进一步对油橄榄PLATZ家族转录因子的生物学研究提供了一定基础。