基于转录组SSR的三角梅遗传多样性分析

为揭示三角梅的遗传背景，本研究采用软件MicroSAtellite搜索其苞片转录组SSR位点，使用Primer Premier 5软件设计50对SSR引物，将筛选出的多态性引物用于55份三角梅材料的聚丙烯酰胺凝胶电泳，采用Popgene 32、PowerMarker V3.25和Structure V2.3.4等软件分析三角梅遗传多样性。结果显示，从50对SSR引物中筛选出25对条带清晰且多态性好的引物，25对SSR引物共检测到76个等位基因，平均每对引物有3个等位基因，平均有效等位基因数为2.30，引物多态性信息量(PIC)在0.01～0.66之间，均值为0.38。55个三角梅材料间的遗传距离为0.01～0.92，平均遗传距离为0.43；在遗传距离0.44处，聚类分析将55份材料分为3个群体。与印度三角梅栽培种比较而言，本实验研究的三角梅材料的遗传多样性水平不高，结果可为三角梅品种鉴定、保护及进化提供一定参考价值。