葡萄TPS基因家族的鉴定与表达分析 |
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作者姓名: | 陈天池 吴月燕 沈乐意 张敏 肖旭腾 董昳伶 徐涛 姜雨琦 李佳程 谢晓鸿 |
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作者单位: | 1. 浙江万里学院生物与环境学院;2. 上海海洋大学水产与生命学院;3. 浙江万里学院设计艺术与建筑学院 |
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基金项目: | 浙江省重点研发计划项目(2021C02053); |
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摘 要: | 为了明确TPS基因家族在葡萄非生物胁迫下的表达特性,在生物信息分析的基础上,以‘鄞红’葡萄(Vitis vinifera ‘Yinhong’)扦插苗为试验材料,利用RT-qPCR技术检测了盐胁迫和光胁迫处理对葡萄TPS家族基因成员表达的影响。结果显示,葡萄TPS基因家族有9个成员,可分为3个亚族,分布在8条染色体上。通过氨基酸多重序列比对,发现葡萄(Vitis vinifera)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa) TPS家族基因都存在G-X-FLH-X-PFPS-X-E-X5-P-X-R和X-F-X-T-X-D-X-ARHF-X2的特征序列。motif分析发现,VvTPS06和VvTPS07两个基因含有相同的氨基酸保守序列。亚细胞定位预测显示葡萄TPS基因主要分布在细胞质、叶绿体和细胞核中,其中VvTPS06、VvTPS07、VvTPS09定位于叶绿体中可能与植物光合作用相关。蛋白质二级结构表明,葡萄TPS蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。基因芯片表达显示,VvTPS02、VvTPS03、VvTPS05、VvTPS07在葡萄不同时期...
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关 键 词: | 海藻糖 葡萄 TPS基因家族 非生物胁迫 RT-qPCR |
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