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伞形科四种药用植物鲨烯合酶的生物信息学分析
作者姓名:张丽  杨娜  关鑫  张武  王长宝
作者单位:1. 佳木斯大学理学院;2. 玉林师范学院生物与制药学院
基金项目:国家自然科学基金项目(81441132);;国家标本平台教学标本子平台运行服务项目子课题(2005DKA21403-JK);
摘    要:鲨烯合酶(squalene synthase, SQS)是三萜类化合物合成的关键调控酶。本研究利用生物信息学软件,从蛋白质理化性质、亚细胞定位,蛋白质结构和系统发育关系等方面分析了伞形科四种药用植物的SQS序列。结果表明:除积雪草外,其余植物的SQS均为稳定蛋白;所有SQS序列都存在明显的疏水区/亲水区,属亲水蛋白;全部SQS序列主要定位于细胞质和质膜,均未发现信号肽,但C端均存在2处跨膜区域;二级结构和功能域均以无规则卷曲和α-螺旋为主要结构元件;系统发育分析与物种的分类关系是一致的。这些结果为深入认识鲨烯合酶结构与功能的关系及其在伞形科植物中的分子进化提供了科学依据。

关 键 词:伞形科  鲨烯合酶  生物信息学分析
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