| 盐胁迫下转 DcCIPK24 拟南芥的转录组比较分析 |
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| 引用本文： | 张婷婷,谭永强,刘莹,袁改改,芮荣涛,周扬,凌冬. 盐胁迫下转 DcCIPK24 拟南芥的转录组比较分析[J]. 广东农业科学, 2023, 50(10): 75-84 |
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| 作者姓名： | 张婷婷 谭永强 刘莹 袁改改 芮荣涛 周扬 凌冬 |
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| 作者单位： | 1. 襄阳市农业科学院,湖北 襄阳 441057;2. 海南大学热带农林学院（农业农村学院、乡村振兴学院）/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室,海南 海口 570228 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金（319MS009）;海南省教育厅项目（Hys2020-242）;海南大学横向课题（HD-KYH-2023093）;襄阳市农业科学院特色产业科普基地项目（XAAS2022025） |
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| 摘 要： | 【 目 的】 探 究 铁 皮 石 斛（Dendrobium catenatum Lindl.）DcCIPK24 的 下 游 响 应 基 因, 为 研 究DcCIPK24 提高耐盐性的分子调控途径提供指导。【方法】利用 Illumina NovaSeq 6000 测序平台对 200 mmol/L NaCl 处理和对照组的转 DcCIPK24 拟南芥、野生型拟南芥进行测序,分析差异表达基因的富集通路,并对通路中的差异基因进行荧光定量 PCR 验证。【结果】盐胁迫下,从 2 个转基因拟南芥株系与野生型拟南芥的比较组合中共鉴定出 96 个差异表达基因;GO 注释分析发现 96 个差异基因主要被富集在分子功能相关通路;KEGG 富集分析发现差异基因主要被注释在氨基糖和核苷酸糖代谢、植物 MAPK 信号通路和甘油酯代谢通路中,选取上调表达的差异基因 AtGPAT5、AtSIRK、AtMEE25、AtUGE5 和下调表达基因 AtAMT1-2、AtATTI3、AtCYP71A25、AtLHCB4.3 进行实时荧光定量 PCR 验证,结果表明盐胁迫下 8 个差异基因表达趋势与转录组数据基本一致。【结论】盐胁迫下,DcCIPK24 主要通过氨基糖和核苷酸糖代谢途径、植物 MAPK 信号途径和甘油酯代谢通路响应耐盐。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 DcCIPK24 转基因 差异基因 代谢通路 |
Comparative Transcriptome Analysis of DcCIPK24 Transgenic Arabidopsis Under Salt Stress |
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| ZHANG Tingting,TAN Yongqiang,LIU Ying,YUAN Gaigai,RUI Rongtao,ZHOU Yang,LING Dong. Comparative Transcriptome Analysis of DcCIPK24 Transgenic Arabidopsis Under Salt Stress[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2023, 50(10): 75-84 |
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| Authors: | ZHANG Tingting TAN Yongqiang LIU Ying YUAN Gaigai RUI Rongtao ZHOU Yang LING Dong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium catenatum DcCIPK24 transgenic differential genes metabolic pathway |
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