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陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh) 的克隆及生物信息学分析
引用本文:邢淑莲,姚艳丽,徐 磊,胡小文,刘 洋.陆稻过氧化氢酶基因(OsCATB-lh) 的克隆及生物信息学分析[J].广东农业科学,2015,42(19):106-110.
作者姓名:邢淑莲  姚艳丽  徐 磊  胡小文  刘 洋
作者单位:中国热带农业科学院湛江实验站/ 中国热带农业科学院热带旱作农业研究中心,广东 湛江 524013
基金项目:中国热带农业科学院湛江实验站科研启动 专项资金(zjky201304)
摘    要:为深入了解陆稻过氧化氢酶(CAT)基因的序列特点和生物信息学信息,以粳型陆稻品种泸旱3号为材料,利用同源克隆技术成功获得1条陆稻CAT基因序列(Gen Bank登录号:KR133179)。该序列全长1 739 bp,其中编码区ORF全长1 479 bp,编码492个氨基酸。生物信息学分析发现,此基因是位于水稻基因组第6号染色体的单拷贝基因。对其编码蛋白分析表明,其具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。与水稻CAT基因序列(Os CATB)进行比较发现,Os CATB-lh与水稻Os CATB基因核苷酸序列一致性达到99%,存在6个核苷酸差异位点;与水稻Os CATB蛋白序列一致性为99%,有3个氨基酸变异位点。

关 键 词:陆稻  过氧化氢酶  基因克隆  序列分析

Cloning and bioinformatics analysis of catalase gene in upland rice
Abstract:
Keywords:
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