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绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析
引用本文:邬张颖,徐凡舒,钟依妮,马佳莹,朱欣,张慧娟,蒋明.绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析[J].贵州农业科学,2020,48(1):99-103.
作者姓名:邬张颖  徐凡舒  钟依妮  马佳莹  朱欣  张慧娟  蒋明
作者单位:台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000,台州学院生命科学学院,浙江椒江318000
基金项目:2018年度台州市大学生科技创新项目“绿萝叶腐病病原菌的分子鉴定”
摘    要:为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1 700bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1 551bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。

关 键 词:绿萝  叶腐病病原菌  菌株LR12  胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种  16S  rDNA  克隆

Cloning and Analysis of 16S rDNA Sequence from a Strain Causing Leaf Rot in Epipremnum aureum
WU Zhangyin,XU Fanshu,ZHONG Yini,MA Jiaying,ZHU Xin,ZHANG Huijuan,JIANG Ming.Cloning and Analysis of 16S rDNA Sequence from a Strain Causing Leaf Rot in Epipremnum aureum[J].Guizhou Agricultural Sciences,2020,48(1):99-103.
Authors:WU Zhangyin  XU Fanshu  ZHONG Yini  MA Jiaying  ZHU Xin  ZHANG Huijuan  JIANG Ming
Abstract:
Keywords:
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