| 柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达 |
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| 引用本文： | 彭蕴,雷天刚,邹修平,张靖芸,张庆雯,姚家欢,何永睿,李强,陈善春. 柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达[J]. 中国农业科学, 2020, 53(9): 1820-1829. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2020.09.010 |
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| 作者姓名： | 彭蕴 雷天刚 邹修平 张靖芸 张庆雯 姚家欢 何永睿 李强 陈善春 |
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| 作者单位： | 西南大学/中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔品种改良中心,重庆 400712 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2018YFD0201500);国家重点研发计划(2018YFD1000300);中央高校基本科研业务费(SWU115025);中央高校基本科研业务费(XDJK2018C034);广西科技重大专项(桂科AA18118046-6);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-26) |
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| 摘 要： | 【目的】前期根据转录组数据挖掘柑橘单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过关联分析获得14个与柑橘溃疡病耐/感性关联的SNP。以此为基础,本研究利用柑橘杂交群体验证这些位点与柑橘溃疡耐/感性的相关性,以期获得显著相关的SNP,并对其相关的基因进行柑橘溃疡病菌(Xanthomonas citri subsp. citri,Xcc)和植物激素诱导表达分析。【方法】以抗病和敏感柑橘品种及其杂交F1代群体共143个材料为试材,采用离体叶片针刺接种法进行溃疡病抗性鉴定;利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术,对F1群体进行SNP分型;使用DPS软件对F1群体的溃疡病耐/感性表型和SNP基因型进行相关分析;实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析其中一个SNP相关的柑橘钙依赖性蛋白激酶基因(calcium-dependent protein kinase gene,CDPK)的诱导表达模式。【结果】供试杂交F1代群体的病斑面积在0.75—3.29...
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| 关 键 词： | 柑橘溃疡病 柑橘溃疡病菌 单核苷酸多态性 钙依赖性蛋白激酶基因 诱导表达 |
| 收稿时间： | 2019-12-09 |
Verification of SNPs Associated with Citrus Bacterial Canker Resistance and Induced Expression of SNP-Related Calcium-Dependent Protein Kinase Gene |
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| Yun PENG,TianGang LEI,XiuPing ZOU,JingYun ZHANG,QingWen ZHANG,JiaHuan YAO,YongRui HE,Qiang LI,ShanChun CHEN. Verification of SNPs Associated with Citrus Bacterial Canker Resistance and Induced Expression of SNP-Related Calcium-Dependent Protein Kinase Gene[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2020, 53(9): 1820-1829. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2020.09.010 |
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| Authors: | Yun PENG TianGang LEI XiuPing ZOU JingYun ZHANG QingWen ZHANG JiaHuan YAO YongRui HE Qiang LI ShanChun CHEN |
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| Affiliation: | National Center for Citrus Variety Improvement, Citrus Research Institute, Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences, Chongqing 400712 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | citrus bacterial canker (CBC) Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) single nucleotide polymorphism (SNP) calcium-dependent protein kinase gene (CDPK) induced expression |
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