通过整合转录组与代谢组解析不同类型椰子的脂肪酸调控网络 |
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引用本文: | 邓渊,赖军,毛梦迪,张越冉,李淳,杨君,王守创,罗杰. 通过整合转录组与代谢组解析不同类型椰子的脂肪酸调控网络[J]. 热带生物学报, 2022, 13(5): 478-487. DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2022.05.008 |
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作者姓名: | 邓渊 赖军 毛梦迪 张越冉 李淳 杨君 王守创 罗杰 |
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作者单位: | 海南大学 热带作物学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口 570228 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31960213) |
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摘 要: | 为了探究不同类型椰子中脂质种类和含量的差异,本研究利用非靶向代谢组学方法对海南高种和矮种椰子椰肉组织的代谢物进行了分析,共检测到12 579种代谢信号,其中鉴定了564种代谢物,包括氨基酸、脂肪酸、类黄酮等。定量分析表明高种椰子的脂质总体含量高于矮种椰子,其中绿矮椰子脂质含量最低。甘油脂、鞘脂和脂肪酰是不同类型椰子中主要的差异物质。转录组数据结果表明,不同类型椰子中的差异基因主要参与脂肪酸代谢、α-亚麻酸代谢、木质素代谢和苯丙烷代谢。基于表达模式的不同将差异基因划分为20个不同的模块,其中“Melightyellow”模块与差异积累的脂肪酸高度相关。通过分析模块中脂质途径结构基因启动子区的cis-element,发现大多数脂质途径基因的启动子区存在多个MYB家族的结合位点及大量的激素信号响应元件。结果表明,MYB家族的转录因子可能在脂质的合成调控中发挥重要作用,并且激素可能作为一种信号分子参与到脂质的合成调控中。本研究通过组合策略对不同品种椰肉组织脂质差异的分子机理进行分析,并进一步构建了转录因子-结构基因-代谢物的合成调控网络,为后续解析脂质合成调控的分子机制提供了资源,为油脂椰子品...
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关 键 词: | 椰子 代谢组 转录组 WGCNA 脂质 |
收稿时间: | 2022-02-11 |
Elucidation of the fatty acid regulatory network for different coconut varieties by integrating transcriptome and metabolome |
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Affiliation: | College of Tropical Crops/ Hainan Key Laboratory of Sustainable Utilization of Tropical Biological Resources, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China |
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