| 6个不同海域文蛤地理群体的亲缘关系分析 |
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| 引用本文： | 王超,陈爱华,曹奕,吴杨平,张雨,姚国兴,蔡永祥. 6个不同海域文蛤地理群体的亲缘关系分析[J]. 海洋渔业, 2016, 0(3): 262-272. DOI: 10.3969/j.issn.1004-2490.2016.03.005 |
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| 作者姓名： | 王超 陈爱华 曹奕 吴杨平 张雨 姚国兴 蔡永祥 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;江苏省海洋水产研究所,南通226007;2. 江苏省海洋水产研究所,南通,226007 |
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| 基金项目： | 江苏省科技厅重点研发项目(BE2015324)，江苏省水产三新工程重大项目(D2014-16)，江苏省属公益类科研院所能力提升项目(BM2015017)，江苏省水产良种保种和亲本更新项目(BZ2014;2015)，南通市农业科技创新项目(HL2014007) |
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| 摘 要： | 为探究中国辽东半岛海域(辽宁群体)、长江口及其两翼海域(江苏群体)、台湾海峡西部海域(福建群体)、珠江口及其两翼海域(广东群体)、北部湾海域(广西群体)以及日本伊势湾海域(三重群体)6个不同海域文蛤(Meretrix meretrix)地理群体的亲缘关系,采用18S rRNA基因、线粒体细胞色素氧化酶c亚基Ⅰ(COⅠ)及16S rRNA基因3种分子标记进行序列测定与分析。测序结果显示,3种基因序列长度分别在1 854、658、596 bp左右;18S rRNA基因碱基组成无偏异,序列较为保守;COⅠ与16S rRNA基因A+T平均含量明显大于G+C含量,符合线粒体基因组成特征。通过Meg Align软件比对6个地理群体文蛤,序列相似百分比分别为99.7%~100.0%(18S)、91.7%~99.8%(COⅠ)、90.2%~99.8%(16S),其中三重文蛤序列差异最大;以文蛤属的帘文蛤(Meretrix lyrata)作外群,采用MEGA 5.03软件中相邻连接法(NJ)构建系统发育树显示,我国沿海5个文蛤群体聚为一枝且与日本三重文蛤分开,自展值分别为67%(18S)、99%(COⅠ)、98%(16S);我国沿海5个文蛤群体中,辽宁、江苏、福建文蛤群体首先聚在一起,其次是广西文蛤群体,最后是广东文蛤群体。研究结果表明,辽宁、江苏、福建文蛤群体同源性较高,亲缘关系最近;广西文蛤群体、广东文蛤群体与我国其它文蛤群体间遗传差异较大,地理遗传分化明显;而日本三重文蛤与我国沿海文蛤可定为文蛤的2个地理亚种。
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| 关 键 词： | 文蛤 18S rRNA基因 COⅠ基因 16S rRNA基因 系统发育 |
Genetic relationship analysis of six Meretrix meretrix populations from different sea areas |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Meretrix meretrix 18S rRNA gene COⅠ gene 16S rRNA gene phylogeny |
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