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紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:李春霞,乔中全,邓涪元,陆柳淑,李雪露,何钢.紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析[J].湖南林业科技,2023(1):24-30.
作者姓名:李春霞  乔中全  邓涪元  陆柳淑  李雪露  何钢
作者单位:1. 中南林业科技大学生命科学与技术学院
摘    要:为探究类黄酮葡萄糖基转移酶基因(UFGT)在紫薇花青素生物合成中的分子机制及表达情况,本文以紫薇花瓣为试材,根据紫薇转录组序列设计特异性引物,通过PCR克隆LiUFGT基因开放序列,进行生物信息学分析,再对LiUFGT基因进行荧光定量PCR分析。结果表明:LiUFGT基因的开放阅读框长1 431 bp,编码476个氨基酸,相对分子量为52 465.22 Da,理论等电点为5.66;LiUFGT蛋白为不稳定疏水蛋白,且以α-螺旋和无规则卷曲为主;经过多序列比对发现,LiUFGT蛋白和石榴的相似性最高,为68.70%;系统进化分析表明,LiUFGT蛋白与杨树、石榴、夏栎UFGT蛋白的同源性最高。此外,LiUFGT基因在红色花瓣紫薇中的表达量最高,在白色中最低,说明LiUFGT基因对紫薇花色基因具有直接调控的作用。本研究结果为进一步阐明LiUFGT基因在紫薇花青素合成机制中的调控作用提供了理论基础。

关 键 词:紫薇  LiUFGT基因  基因克隆  生物信息学分析
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