紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析 |
| |
引用本文: | 李春霞,乔中全,邓涪元,陆柳淑,李雪露,何钢.紫薇LiUFGT基因的克隆与生物信息学分析[J].湖南林业科技,2023(1):24-30. |
| |
作者姓名: | 李春霞 乔中全 邓涪元 陆柳淑 李雪露 何钢 |
| |
作者单位: | 1. 中南林业科技大学生命科学与技术学院 |
| |
摘 要: | 为探究类黄酮葡萄糖基转移酶基因(UFGT)在紫薇花青素生物合成中的分子机制及表达情况,本文以紫薇花瓣为试材,根据紫薇转录组序列设计特异性引物,通过PCR克隆LiUFGT基因开放序列,进行生物信息学分析,再对LiUFGT基因进行荧光定量PCR分析。结果表明:LiUFGT基因的开放阅读框长1 431 bp,编码476个氨基酸,相对分子量为52 465.22 Da,理论等电点为5.66;LiUFGT蛋白为不稳定疏水蛋白,且以α-螺旋和无规则卷曲为主;经过多序列比对发现,LiUFGT蛋白和石榴的相似性最高,为68.70%;系统进化分析表明,LiUFGT蛋白与杨树、石榴、夏栎UFGT蛋白的同源性最高。此外,LiUFGT基因在红色花瓣紫薇中的表达量最高,在白色中最低,说明LiUFGT基因对紫薇花色基因具有直接调控的作用。本研究结果为进一步阐明LiUFGT基因在紫薇花青素合成机制中的调控作用提供了理论基础。
|
关 键 词: | 紫薇 LiUFGT基因 基因克隆 生物信息学分析 |
|
|