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豌豆CBF基因家族的生物信息学及低温胁迫下的表达分析
作者姓名:张楠  王旺田  孙万仓  武军艳  马骊  杨刚  蒲媛媛  刘丽君
作者单位:1. 甘肃农业大学生命科学技术学院;2. 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室(甘肃农业大学)
基金项目:甘肃省科技计划项目(21JR7RA835);;国家现代农业产业技术体系项目(CARS-12);
摘    要:【目的】为了更加全面地探究CBF基因家族在豌豆中的进化及生物学特征。【方法】通过生物信息学方法从基因家族鉴定、结构分析、蛋白基本理化性质、亚细胞定位、染色体定位、顺式作用元件、蛋白质相互作用与表达分析等方面,对豌豆PsCBF基因家族进行系统鉴定和分子特征分析。【结果】在豌豆中共鉴定出21个PsCBF基因,染色体定位显示18个PsCBF基因分布在1、2、4、6与7号染色体上,其余3个未组装到染色体上(PsCBF19~PsCBF21)。21个PsCBF基因编码蛋白的氨基酸数在123(PsCBF09)~349(PsCBF11),且均属于疏水性蛋白。亚细胞定位预测显示18个PsCBF基因(85.71%)定位在细胞核上,二级结构主要以无规则延伸为主。蛋白基序显示同一类群的基因都具相似的保守基序特征且该家族成员包含1~7个保守基序;同一类群的基因也具有相似的基因结构,且该家族基因含1~2个外显子。PsCBF基因启动子区分析表明其含有多种顺势作用元件,在激素反应,组织特异表达以及逆境响应中起作用。蛋白聚类网络图显示其蛋白可能在豌豆应对非生物胁迫中起调节作用。此外,本研究发现低温胁迫后K2<...

关 键 词:豌豆  CBF基因家族  生物信息学分析  基因表达分析
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