基于SSR标记的楠木核心种质构建 |
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作者姓名: | 张群 程晓玲 刘明 谢佳鑫 彭建 余波 晏奎 辜云杰 杨汉波 |
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作者单位: | 1. 成都兴绿林业科技发展有限公司;2. 布拖林业和草原局;3. 四川省林业科学研究院森林与湿地生态恢复与保育四川省重点实验室;4. 长江上游林业生态工程四川省重点实验室,长江上游森林资源保育与生态安全国家林业和草原局重点实验室,华西雨屏区人工林生态系统研究长期科研基地,四川农业大学林学院 |
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基金项目: | 四川省科技支撑计划项目(2021YFYZ0032);;四川省自然科学基金(2022NSFSC1062);;世界银行贷款四川省长江经济带珍稀树种保护与发展项目(510201202038467); |
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摘 要: | 楠木是我国特有的珍贵用材树种,研究楠木核心种质的构建策略对强化楠木资源保护与利用,加快楠木良种选育进程具有重要意义。利用14对SSR引物,以102份楠木种质资源为材料,利用M策略、随机取样法、遗传多样性最大法和等位基因最大法分别构建核心种质。采用等位基因数、有效等位基因数和Shannon’s信息指数等遗传多样性指标进行比较分析来确定最适合的楠木核心种质构建方法。14对SSR引物共检测到166个等位基因,平均有效等位基因数为4.875,Shannon’s信息指数为1.297,表明楠木种质资源具有较为丰富的遗传多样性。在较高抽样比例时,等位基因最大化、遗传多样性最大化法和M策略抽取的核心种质均对原有种质有较好的代表性。等位基因最大化法抽取的核心种质等位基因保留率与M策略均达100.00%,但其有效等位基因数和遗传多样性的保留率相对较低;遗传多样性最大化法抽取的核心种质的Shannon’s信息指数保留率与M策略相差不大,但其等位基因和有效等位基因数保留率低于M策略。综合考虑遗传多样性参数,M策略构建的核心种质能最大程度地代表原有种质,为最优的取样策略。主坐标分析结果也证明M策略构建的核心种质...
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关 键 词: | 楠木 SSR 核心种质 分子身份信息 |
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