| 斑鳜胃蛋白酶原C及其5'侧翼区的克隆及序列特征分析 |
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| 引用本文： | 邓燕飞,赵金良,吴雪峰.斑鳜胃蛋白酶原C及其5'侧翼区的克隆及序列特征分析[J].上海海洋大学学报,2009(6):641-648. |
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| 作者姓名： | 邓燕飞 赵金良 吴雪峰 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海201306 |
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| 基金项目： | 江苏省农业科技攻关项目（BE2007329）;上海海洋大学博士启动基金（07274）;上海教委项目（05KZ02）;上海市重点学科建设项目（Y1101） |
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| 摘 要： | 采用RT—PCR和RACE等技术克隆了斑鳜（Sinipercascherzeri）胃蛋白酶原C（pepsinogenC，PGC）的cDNA全长和部分DNA序列，结果表明：PGCcDNA序列全长1505bp，5’端非翻译区37bp，3’端非翻译区304bp，开放阅读框架（ORF）1164bp，共编码含有387个氨基酸的蛋白质，包括由16个氨基酸组成的信号肽、39个氨基酸的激活肽和332个氨基酸的成熟肽。斑鳜PGC氨基酸序列与斜带石斑鱼、伯氏豚虾虎鱼、狼鲈、美洲红点鲑4种鱼的相似度分别为92．0％、91．5％、90．2％、89．1％，与非洲爪蟾、鸡、人、兔、褐家鼠的序列相似度分别为76．8％、72．8％、72．5％、69．9％、67．3％，表明PGC基因在长期的进化中较为保守。PGC基因由9个外显子和8个内含子组成，内含子剪切位点符合GT—AG规则，在第7含子中发现（GACA）6、（CA）6类型的微卫星序列，第8内含子中发现（TG），类型的微卫星序列。采用锚定PCR方法获得了PGC5’侧翼区长1924bp的序列，启动子区域位于-40～＋10bp，包含TATA盒以及GATA-1、CdxA、Hand1／E47、AP-1、Nkx-2、S8、FOX J2等转录因子的结合位点。结果为进一步研究该基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。
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| 关 键 词： | 斑鳜 胃蛋白酶原C 5’侧翼区 启动子 |
Molecular cloning and characterization of pepsinogen C gene and its 5' flanking region from mandarin fish Siniperca scherzeri |
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| DENG Yan-fei,ZHAO Jin-liang,WU Xue-feng.Molecular cloning and characterization of pepsinogen C gene and its 5' flanking region from mandarin fish Siniperca scherzeri[J].Journal of Shanghai Ocean University,2009(6):641-648. |
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| Authors: | DENG Yan-fei ZHAO Jin-liang WU Xue-feng |
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| Institution: | (Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources and Utilization, Ministry of Agriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Siniperca scherzeri pepsinogen C 5＇ flanking region promoter |
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