烟草Ⅰ型几丁质酶的生物信息学分析 |
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引用本文: | 耿莉娜.烟草Ⅰ型几丁质酶的生物信息学分析[J].中国农学通报,2014,30(31):95-99. |
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作者姓名: | 耿莉娜 |
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作者单位: | 中国烟草总公司重庆市公司烟草科学研究所 |
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基金项目: | 中国烟草总公司科技重大专项项目“烟草抗CMV和赤星病连锁分子标记开发及NC82、K326 品种抗性改良”(110201301009) |
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摘 要: | 旨在对烟草Ⅰ型几丁质酶进行生物信息学分析,了解其生物学特征,为下一步研究烟草Ⅰ型几丁质酶在烟草抗病过程中的作用奠定基础。采用生物信息学的方法,对已在NCBI 上登陆的烟草、拟南芥、水稻、菜豆的Ⅰ型几丁质酶(chitinase,ChiⅠ)氨基酸序列特征和进化关系进行了预测和分析。结果表明,这4 种植物Ⅰ型几丁质酶的分子量大小在28~37 kDa之间,均具有信号肽,结构域高度保守,均具有几丁质结合区(Cht BD1)和催化功能区(Glyco_hydro_19);烟草中的3 种Ⅰ型几丁质酶序列相似性较高,可以聚为一类;烟草与拟南芥和菜豆中的一种ChiⅠ遗传距离较近,而与水稻中ChiⅠ的遗传距离较远。通过分析发现,烟草Ⅰ型几丁质酶有着与其他植物中该酶相同的特性,为进一步研究烟草抗病蛋白提供理论依据。
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关 键 词: | 糯玉米 糯玉米 鲜穗产量 农艺性状 灰色关联度分析 |
收稿时间: | 8/4/2014 12:00:00 AM |
修稿时间: | 8/4/2014 12:00:00 AM |
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