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结缕草属植物SRAP-PCR体系的建立和优化
引用本文:薛丹丹,郑轶琦,王志勇,郭海林,陈宣,刘建秀.结缕草属植物SRAP-PCR体系的建立和优化[J].草业学报,2008,17(6):93-101.
作者姓名:薛丹丹  郑轶琦  王志勇  郭海林  陈宣  刘建秀
作者单位:南京农业大学园艺学院,江苏,南京,210095;江苏省中国科学院植物研究所,江苏,南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏,南京,210014
基金项目:江苏省科技攻关计划 , 国家自然科学基金 , 江苏省高技术研究发展计划项目  
摘    要:以SDS法提取的结缕草属植物叶片DNA 为模板,分别采用单因子试验和正交设计试验2种方法,对影响结缕草属植物SRAP-PCR 的MG2+ 、dNTP、引物、TaqDNA 聚合酶和模板DNA 五个因素进行优化试验。单因子试验分别研究各因素在多水平条件下对SRAP-PCR 反应体系的影响,得到最佳反应条件。正交设计采用L16(45)方案,综合考虑各因素间的相互作用,通过直观分析法获得各影响因素的最佳反应水平。根据4对引物对6 份结缕草属植物材料扩增结果的验证比较,2种方法所获得的最佳反应体系存在一定的差异。通过综合比较和分析2种方法的优化体系扩增出的条带数、多态性条带数及多态性比率,最终建立了结缕草属植物SRAP-PCR 的最佳反应体系:MG2+2.00mmol/L、dNTP220μmol/L、引物0.20μmol/L、TaqDNA 聚合酶0.50U、模板DNA60ng、2μL10×buffer,总体积为20μL。这一优化体系的建立为今后利用SRAP标记技术进行结缕草属植物遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了科学的依据。

关 键 词:结缕草属植物  SRAP标记  单因子试验  正交设计  体系优化
收稿时间:1900-01-01;

Establishment and optimization of SRAP-PCR reaction system for Zoysia
XUE Dan-dan,ZHENG Yi-qi,WANG Zhi-yong,GUO Hai-lin,CHEN Xuan,LIU Jian-xiu.Establishment and optimization of SRAP-PCR reaction system for Zoysia[J].Acta Prataculturae Sinica,2008,17(6):93-101.
Authors:XUE Dan-dan  ZHENG Yi-qi  WANG Zhi-yong  GUO Hai-lin  CHEN Xuan  LIU Jian-xiu
Abstract:
Keywords:Zoysia  SRAP markers  single factor test  orthogonal design  optimized system
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