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WISP基因家族的克隆、表达及系统进化树的构建
引用本文:孙婷,刘伟,徐鹏,孙效文. 鲤WISP基因家族的克隆、表达及系统进化树的构建[J]. 水产学报, 2012, 36(2): 180-190
作者姓名:孙婷  刘伟  徐鹏  孙效文
作者单位:1. 中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京100141;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
2. 中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京100141;大连海洋大学生命科学与技术学院,辽宁大连116023
3. 中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京,100141
基金项目:国家“八六三”高技术研究发展计划(2011AA100401);公益性行业(农业)科研专项项目(200903045)
摘    要:Wnt1诱导分泌蛋白(WISP)基因家族与CYR61、CTGF、NOV基因共同构成了CCN家族。研究通过鲤基因组序列与斑马鱼WISP基因编码区全序列的比对获得WISP1a、WISP1b、WISP2、和WISP3等4条序列。经过克隆、测序、比对拼接得到其开放阅读框,分别是1 089、1 077、1 038和1 026 bp,它们都是由5个外显子和4个内含子构成,分别编码362、358、345和341个氨基酸。分子系统学分析表明,鲤4个WISP基因具有高度同源性,其中WISP1a、WISP1b和WISP2均含有4个模块,WISP3缺少第2个模块。通过RT-PCR检测WISP基因在鲤组织中的表达,结果表明,WISP1a鲤在13个组织中均有表达,皮肤中表达最高,脾、肠、卵巢次之,其他组织中表达较低。WISP1b在精巢、脑、皮肤、卵巢中表达较高。WISP2在血液、鳃中表达较高。WISP3在血液、脑、肝中表达较高。实时荧光定量PCR法分析WISP基因在鲤胚胎发育时期的表达,结果表明,除WISP3外,WISP1a、WISP1b和WISP2在前期表达较高,36 h表达最低,随后逐渐升高至第6天开始下降。

关 键 词:  Wnt1诱导分泌蛋白  克隆  基因  表达
收稿时间:2011-10-02
修稿时间:2011-11-08

Molecular cloning, expression and phylogenetic tree's construction of WISP gene family in common carp
SUN Ting,LIU Wei,XU Peng and SUN Xiao-wen. Molecular cloning, expression and phylogenetic tree's construction of WISP gene family in common carp[J]. Journal of Fisheries of China, 2012, 36(2): 180-190
Authors:SUN Ting  LIU Wei  XU Peng  SUN Xiao-wen
Affiliation:The Centre for Applied Aquatic Genomics,Chinese Academy of Fishery Sciences;College of Fishery and Life Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai,The Centre for Applied Aquatic Genomics,Chinese Academy of Fishery Sciences;College of Aqua-Life Science and Technology, Dalian Fisheries University, Dalian,Liaoning,The Centre for Applied Aquatic Genomics,Chinese Academy of Fishery Sciences,The Centre for Applied Aquatic Genomics,Chinese Academy of Fishery Sciences
Abstract:
Keywords:common carp(Cyprinus carpio)   WISP   clone   gene   expression
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