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北方黑土土壤细菌16S rDNA扩增体系的优化
引用本文:李秋红,吴凤芝. 北方黑土土壤细菌16S rDNA扩增体系的优化[J]. 土壤学报, 2008, 45(2): 341-347
作者姓名:李秋红  吴凤芝
作者单位:东北农业大学园艺学院,哈尔滨,150030
摘    要:采用降落PCR方法扩增目的基因,设计两次正交试验对PCR反应体系中的各组分浓度进行筛选,同时对退火时间、延伸时间及循环次数进行摸索。结果表明,适合北方黑钙土土壤细菌16S rDNA扩增体系为:在25μl体系中,10×buffer2.5μl,DNA模板20ng,Mg2+2.5mmolL-1,dNTPs0.25mmolL-1,引物0.3μmolL-1,TaqDNA聚合酶1.5U。降落PCR扩增程序为:95℃,5min;95℃,45s;65~56℃,60s;72℃,90s;每两个循环降低1℃。95℃,45s;5.5℃,60s;72℃,90s;10个循环。最后72℃,10min。

关 键 词:土壤细菌16S rDNA  降落PCR  优化
收稿时间:2006-12-25
修稿时间:2006-12-25

OPTIMIZATION OF 16S rDNA AMPLIFICATION SYSTEM OF BACTERIA IN BLACK SOIL IN NORTH CHINA
Li Qiuhong and Wu Fengzhi. OPTIMIZATION OF 16S rDNA AMPLIFICATION SYSTEM OF BACTERIA IN BLACK SOIL IN NORTH CHINA[J]. Acta Pedologica Sinica, 2008, 45(2): 341-347
Authors:Li Qiuhong and Wu Fengzhi
Affiliation:Li Qiuhong Wu Fengzhi(College of Horticulture,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)
Abstract:
Keywords:Soil bacteria 16S rDNA  TD PCR  Optimization  
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