兔眼蓝莓‘园蓝’幼叶转录组生物信息学分析

为探索兔眼蓝莓品种‘园蓝’遗传信息，本研究利用高通量测序技术对贵州栽培的‘园蓝’幼叶转录组进行了测序和生物信息学分析。共获得约1.4 Gb的纯净数据，拼装了32 093条unigenes。GO数据库注释到的unigenes涉及生物学过程、细胞成分及分子功能相关的48种生理代谢功能；27 137条unigenes能被KOG数据库注释，涉及25条代谢通路；9 525条unigenes能被KEGG数据库成功注释，涉及5个功能大类、19个功能中类、128条代谢通路；25 418条unigenes可被NR数据库注释；18 309条unigenes可被SwissProt数据库注释。以上4个数据库共注释到25 447条unigenes，占全部unigenes的79.29%；被以上4个数据库均注释到的unigenes为8 846条，占全部unigenes的27.56%。同时，生物信息学分析还显示：全部unigenes中，有758条unigenes编码转录因子，涉及51个家族；2 085条unigenes编码抗性基因，涉及17个家族。共检测到4 827个SSR位点，其中二碱基重复的SSR位点达3 165...