马铃薯全基因组StbZIP基因家族的鉴定及在不同逆境中的表达分析 |
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引用本文: | 水清明,李海珀,韩儆仁,权小兵,秦天元,李亚杰.马铃薯全基因组StbZIP基因家族的鉴定及在不同逆境中的表达分析[J].分子植物育种,2024(3):704-717. |
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作者姓名: | 水清明 李海珀 韩儆仁 权小兵 秦天元 李亚杰 |
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作者单位: | 1. 定西市农业科学研究院;2. 定西市种子站;3. 甘肃农业大学农学院 |
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基金项目: | 甘肃省重大科技专项(20ZD7NA007)资助; |
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摘 要: | 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP)是一种广泛存在于植物中的保守转录因子,其家族成员数目是植物中最丰富的转录因子家族之一。为了解马铃薯StbZIP基因家族的相关信息,本研究通过生物信息学的方法,在二倍体马铃薯‘DM’全基因组中鉴定64个马铃薯StbZIP家族成员,命名为StbZIP1~StbZIP64。通过分析发现,马铃薯StbZIP家族成员不均匀地分布在12条染色体上。生物信息学分析表明,家族成员蛋白长度为132~822 aa,分子量介于15.40~88.18 kD之间,等电点4.74~10.30。系统发育树分析显示,该基因家族可分为11个亚群,其基因主要分布在第1、4和10号染色体上。基因结构和保守基序分析发现,各亚族成员间具有相似的保守基序和进化的保守性。表达模式分析发现,11个亚族内部呈现出响应不同非生物胁迫的表达模式,其中有8个亚族基因都在ABA胁迫24 h时表达量发生显著升高。这些结果为阐明StbZIP基因家族的进化和进一步研究StbZIP基因的功能提供了理论指导。
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关 键 词: | 马铃薯 StbZIP基因家族 比较基因组 基因表达 |
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