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白鲜种子休眠解除过程中的转录组分析
引用本文:闫宗圣,王乾,王蕾,张兰兰,郑开颜,郑玉光,尚晓瑛,房慧勇.白鲜种子休眠解除过程中的转录组分析[J].种子,2022(12):35-40.
作者姓名:闫宗圣  王乾  王蕾  张兰兰  郑开颜  郑玉光  尚晓瑛  房慧勇
作者单位:1. 河北中医学院药学院;3. 北京盈科瑞创新医药股份有限公司
基金项目:河北省自然科学基金(H 2019423140);
摘    要:以解除休眠过程不同阶段的种子为材料,通过高通量测序技术对样品转录组进行测序分析。共获得135.98 Gb的原始数据,302 453条Unigenes,注释到七大功能数据库(GO、KEGG、KOG、NR、TrEMBL、Pfam、Swiss-Prot),分别有139 276(NR:46.05%)、128 449(TrEMBL:42.47%)、86 498(Swiss-Prot:28.60%)、90 564(KOG:29.94%)、103 481(KEGG:34.21%)、108 540(GO:35.89%)以及90 410(Pfam:29.89%)条Unigenes得到功能注释。通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,分别归于59个GO类别和145条代谢途径。同时,有6 081个Unigenes被注释为转录因子。利用高通量测序技术获得白鲜转录组信息,有助于从分子水平对白鲜进行深入研究。

关 键 词:白鲜  休眠解除  转录组  功能注释
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