玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 仝帧翰,刘青青,张严玲,王雷立,李安然,董柯清,王闻琦,王盼盼,王翠玲.玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析[J].作物研究,2022(4):354-362. |
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作者姓名: | 仝帧翰 刘青青 张严玲 王雷立 李安然 董柯清 王闻琦 王盼盼 王翠玲 |
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作者单位: | 河南科技大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金河南省联合基金(U2004153);;河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(202102110010);;国家自然科学基金青年基金(31901561); |
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摘 要: | 克隆玉米伪应答调控基因ZmPRR1-1启动子并对其序列进行分析,以期为深入研究ZmPRR1-1基因的调控机制及基因功能提供参考。以玉米黄早4的叶片为供试材料,参考已公布玉米自交系CML247基因组中ZmPRR1-1启动子的序列信息设计引物,克隆ZmPRR1-1基因的启动子,并利用生物信息学对启动子中的核心区域、顺式作用元件、转录因子结合位点和CpG岛进行预测分析。克隆得到长度约2 600 bp的ZmPRR1-1启动子,预测ZmPRR1-1启动子可能存在2个核心启动子区域,除了存在核心元件TATA-box和启动子增强元件CAAT-box外,还存在光响应、激素应答、胁迫响应等顺式作用元件。转录因子结合位点分析表明,ZmPRR1-1启动子区中预测包含ERF在内的6种转录因子家族,此外在启动子区域中预测存在4个符合限定条件的CpG岛区域。玉米ZmPRR1-1启动子区域存在丰富的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示ZmPRR1-1可能受到外界多种类型调控因子的调控并启动转录起始,且在多种调控网络中发挥功能。
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关 键 词: | 玉米 PRR基因 启动子 克隆 生物信息学分析 |
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