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武陵山西部及邻近地区宽鳍鱲群体遗传多样性和遗传结构
引用本文:覃宁,张利铖,肖梦娜,周旭,张桂蓉,马徐发,魏开建.武陵山西部及邻近地区宽鳍鱲群体遗传多样性和遗传结构[J].中国水产科学,2024,31(3):301-315.
作者姓名:覃宁  张利铖  肖梦娜  周旭  张桂蓉  马徐发  魏开建
作者单位:华中农业大学水产学院, 湖北 武汉 430070 ;贵州省水产研究所, 贵州 贵阳 550025
基金项目:生态环境部生物多样性调查评估项目(2019HJ2096001006)
摘    要:为评估武陵山西部和神农架林区宽鳍鱲(Zacco platypus)群体的种质遗传多样性, 采用线粒体Cyt b 序列和微卫星DNA (SSR)标记对7 个宽鳍鱲群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示, 7 个群体185 个Cyt b 序列中共检测出144 个变异位点和33 个单倍型, 群体间的单倍型多样性(Hd)为0.000~0.887, 核苷酸多样性(π)为0.000~0.275。Cyt b 单倍型的NJ 系统树和中介网络图显示, 7 个群体聚为3 个分支(江口1/江口2, 神农架, 习水/赤水/务川/南川)。分子方差分析(AMOVA)显示7 个群体之间、3 个支系之间存在显著的遗传分化。基于11 个微卫星DNA 位点的分析表明, 宽鳍鱲7 个群体的平均等位基因数(NA)为3.66, 平均Shannon’s 信息指数(I)为0.689, 平均观测杂合度(HO)为0.315, 平均期望杂合度(HE)为0.354, 平均多态信息含量(PIC)为0.409。群体之间的遗传分化指数(FST)变化范围为0.060~0.547, 各群体之间存在显著遗传分化(P<0.05)。UPGMA 系统树和PCoA 分析显示, 7个宽鳍鱲群体聚为4 支, STRUCTURE 聚类分析显示宽鳍鱲7 个群体可划分为4 个最佳遗传组群。AMOVA 分析表明, 宽鳍鱲7 个群体之间、4 个遗传组群之间存在显著的遗传分化。结论认为, 武陵山西部及神农架林区的野生宽鳍鱲群体整体上具有较低的遗传多样性, 且存在显著的遗传分化, 应加强对河流生态和环境的保护, 确保宽鳍鱲野生种质资源的可持续利用。

关 键 词:宽鳍鱲    Cyt  b  序列    微卫星DNA    遗传多样性    遗传结构
收稿时间:2023/10/26 0:00:00
修稿时间:2024/1/9 0:00:00
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