一株自然重组的鸡传染性支气管炎病毒的分离鉴定及分析

本研究从吉林省德惠市某父母代蛋鸡场发生疑似呼吸道病毒感染的鸡群中分离到一株鸡传染性支气管炎病毒(IBV),命名为ck/CH/LJL/130908。该病毒基因型鉴定为Massachusetts型,与H120疫苗株和Mass 41强毒株S1基因的同源性分别为96.4%和94.4%,与H120的亲缘关系更近。但基因组遗传进化分析显示,ck/CH/LJL/130908与Ark病毒遗传关系较近。推测该病毒在起源和进化过程中可能发生了重组。应用Sim Plot软件分析证实了这种推测,表明ck/CH/LJL/130908来源于IBV 4/91、Ark和H120之间的重组。重组位点分别位于基因组ORF1ab的Nsp2、Nsp3、Nsp16和S2编码区。