番茄S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因SlSAMDC1的克隆与序列分析

以蔓陀罗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长eDNA序列为信息探针，筛选NCBI番茄EST数据库，依据同源EST信息，经人工拼接、RT—PCR及RACE技术验证，获得了1个新的SAMDC基因家族成员，命名为SISAMDC1（GenBank登录号：EF550528），并利用染色体步移技术克隆了879bp的上游调控区域。SISAMDC1 eDNA序列全长1847bp，5′-UTR和3′-UTR分别长523和241bp；存在3个ORF（微型uORF、小型uORF和主ORF），主ORF编码360个氨基酸的SAMDC酶原；SISAMDC1基因组序列全长3648bp，有3个内含子，均位于5′-UTR，所有内含子的剪切位点均符合真核生物“GT-AG”规则。SISAMDCl基因与其它植物来源SAMDC基因同源性较高，与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低。表达谱分析发现，SISAM-DCl基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达，果实中的表达量相对较高。生物信息学分析表明，SISMDC1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件，如W—box、TATA—box、CAAT—box等。

Cloning and Sequence Analysis of a S-adenosylmethionine Decarboxylase Gene (SlSAMDC1) in Tomato