红花SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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作者姓名: | 宋梦瑶 赵乐 董诚明 朱畇昊 |
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作者单位: | 1. 河南中医药大学药学院;2. 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:81603232);;国家重点研发计划(编号:2017YFC1702800);;河南省重大科技专项(编号:171100310500);;河南省科技攻关项目(编号:172102310539); |
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摘 要: | SPL基因家族是植物特有的转录因子,广泛参与调控植物生长发育,包括花和果实的发育、胁迫响应和次生代谢物的合成等。为探究红花SPL基因家族的进化和功能,本研究基于红花基因组数据库筛选得到21个SPL基因,利用生物信息学方法对其进行分析。结果表明,红花SPL基因家族鉴定得到的21个成员聚类为6个亚家族,同一个亚家族成员具有相似的基因结构和基序,大多数CtSPL蛋白具有1个完整保守的SBP结构域;CtSPL基因启动子区域存在光反应元件,激素应答元件、胁迫响应元件以及和植物生长发育有关的调控元件;miRNA靶位点预测表明有15个CtSPL基因受miR156家族的调控;表达模式分析表明,CtSPL基因呈现组织特异性表达。经茉莉酸甲酯(MeJA)和表油菜素内酯(EBR)处理后,多数CtSPL基因表达量发生变化,推测这些基因参与了红花不同激素的响应。
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关 键 词: | 红花 SPL基因家族 生物信息学 表达模式 全基因组鉴定 |
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