基于三色堇全长转录组的MYB基因家族鉴定

在全长转录组水平鉴定三色堇(Viola×wittrockiana Gams.)梦蝶品种MYB转录因子家族成员，对其序列特征、进化关系、蛋白质保守基序等生物信息学特征进行鉴定，为三色堇MYB基因功能研究提供参考。鉴定结果表明，三色堇含有121个MYB,包含61个1R-MYB、57个R2R3-MYB与3个3R-MYB类转录因子；保守基序预测得到20个motif,其中motif2分布频次最高(15.2%),motif20分布频次最低(0.3%);利用WebLogo分析鉴定出三色堇R2R3-MYB类转录因子保守结构域含有W型R2R3保守基序；通过三色堇与拟南芥的同源性与进化关系对三色堇基因功能进行预测，得到30个亚群，其中22个亚组能聚集到拟南芥亚群中，可推测这些VwMYB基因具有相似的功能。本研究结果可为三色堇MYB基因的功能挖掘提供理论基础。