细胞保护蛋白PTD-FNK生物信息学分析 |
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引用本文: | 纪伟霞,胡传活,马祺琦,何芝凤,黄芳,汪燕玲.细胞保护蛋白PTD-FNK生物信息学分析[J].江苏农业科学,2022(15):51-57. |
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作者姓名: | 纪伟霞 胡传活 马祺琦 何芝凤 黄芳 汪燕玲 |
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作者单位: | 1. 广西大学动物科学技术学院;2. 广西壮族自治区畜牧研究所 |
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基金项目: | 广西科学研究与技术开发计划(编号:桂科能1598022-2);;广西自然科学基金(编号:2016GXNSFAA380024); |
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摘 要: | PTD-FNK蛋白是人工形成的重组蛋白质,已被证明在细胞凋亡、精子冷冻保存过程中对细胞有一定的保护作用,虽然在实践中应用普遍,但国内未见其机理分析和通过蛋白结合参与调控的报道。结合Protparam、ProtScale等相关在线软件预测和分析PTD-FNK蛋白的理化性质、亲水性、二、三级结构等;分离培养猪睾丸支持细胞,采用HIS pulldown技术拉下PTD-FNK未知的互作蛋白,得到的数据用UniProt数据库对比。生物信息学结果表明,PTD-FNK蛋白编码295个氨基酸,蛋白质分子量33.195 ku,分子式为C1 456H2 225N437O439S10;该蛋白含有PKC、PKA特异性磷酸化的结合位点。得到的互作蛋白有葡萄糖调节蛋白78、波形蛋白-1、组蛋白等。预测PTD-FNK蛋白可能通过PKA、PKC特异性磷酸化结合位点或者与蛋白互作的方式参与细胞凋亡、精子发生等过程。
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关 键 词: | PTD-FNK蛋白 抗凋亡 内质网应激 生物信息学分析 免疫共沉淀 互作蛋白 |
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