小豆WRKY基因家族鉴定及应答锈菌侵染的表达分析

为明确小豆WRKY转录因子在抗锈病中的功能，研究采用生物信息学方法，对小豆基因组中WRKY基因家族进行了分析，结果表明，小豆基因组中共包含90个WRKY转录因子（VaWRKYs），其中82个成员分别定位于小豆的11条染色体上。依据WRKY基因家族高度保守的WRKY七肽域和锌指结构对小豆WRKY家族进行分类，发现VaWRKYs包含GroupⅠ（17个）、GroupⅡ（61个）和GroupⅢ（12个）等3个亚家族，进一步的系统发育分析表明，GroupⅡ亚家族还包括Ⅱ-a(6个)、Ⅱ-b(16个)、Ⅱ-c(21个)、Ⅱ-d(7个)和Ⅱ-e(11个)5个亚组。蛋白序列特征分析发现，VaWRKYs成员在七肽域和锌指结构上存在多个氨基酸位点的变异。利用课题组前期获得的抗病小豆品种接种后24和48 h的转录组数据对VaWRKYs成员的表达进行分析，共检测到82个成员不同水平表达，且多达67个成员的表达水平受锈菌侵染的影响，暗示小豆WRKY基因家族在小豆抗锈病过程中起重要的调控作用。