牛坏死杆菌43K OMP的生物信息学分析及B细胞表位预测

为了对牛坏死杆菌 43K OMP 进行生物信息学分析，并预测其 B 细胞表位，研究利用 Prot Param 在线软件、TMHMM 在线软件、Net Phos 软件、DNA star 软件和 I-TASSER 在线软件，分别对 43K OMP 的理化性质、跨膜区、磷酸化位点、二级结构和三级结构进行分析，用 Bepipred 在线软件和 Ellipro 在线软件对其 B 细胞表位进行预测，并对预测的表位肽进行验证。结果表明 43K OMP 共编码 377 个氨基酸，相对分子质量为 42.927×10³，理论等电点为 8.74，该蛋白在 1-20aa 处存在信号肽区域，无跨膜区，包括 34 个磷酸化位点，具有 10 个构象 B 细胞表位，多个线性 B 细胞表位，合成的 4 表位肽经 ELISA 验证显示反应性良好。通过生物信息学技术分析出 43K OMP 的性质及结构，预测出其具有多个 B 细胞表位，为该蛋白的功能研究及基因工程疫苗的研制提供依据。