黑斑侧褶蛙5类抗菌肽基因的克隆及其成熟肽理化性质的预测 |
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作者姓名: | 季菁菁 夏睿 李晓平 兰天明 徐艳春 |
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作者单位: | 1. 东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨,150040 2. 东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨150040/兰州大学哲学社会学院,兰州730000 3. 东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨150040/深圳华大基因研究院,深圳518083 |
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基金项目: | 中央高校基本科研业务费专项资金项目,哈尔滨市科技创新人才研究专项资金项目 |
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摘 要: | 抗菌肽是蛙类非特异性免疫的重要组成部分,蛙类对环境变化比较敏感,但仍能分布于广泛的地理区域,抗菌肽的多样性和组成是揭示其适应机制的基础。本研究通过RT-PCR技术,从1只黑斑侧褶蛙的皮肤组织中克隆了9条不同的cDNA序列,分属5个家族:Esculentin-1、Esculentin-2、Temporin、Nigrocin-1和Nigrocin-2。其中Esculentin-1、Esculentin-2、Temporin和Nigrocin-1为阳离子抗菌肽,等电点(PI)8.72~9.63,分子量(Mw)1495.87~4862.9,预测的二级结构都具有α-螺旋结构。Nigrocin-2为新发现的一类酸性抗菌肽,等电点PI为4.0,Mw为1798.06,带1个负电荷,预测二级结构不具有α-螺旋结构,呈无规则卷曲。这9条抗菌肽cDNA来自50个阳性克隆,显示出黑斑侧褶蛙抗菌肽具多样性,特殊抗菌肽的发现也预示着黑斑侧褶蛙适应复杂多变环境、分布广泛的生理潜能,但具体功能还需进一步研究。
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关 键 词: | 黑斑侧褶蛙 抗菌肽 cDNA 二级结构 |
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