广西地区一株新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及σC基因遗传进化分析

为了解广西地区新型鸭呼肠孤病毒(novel Duck reovirus, NDRV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变异情况，试验采用RT-PCR方法对某鸭场送检的病料进行病原鉴定，将鉴定为阳性的样品接种于9～10日龄SPF鸡胚尿囊腔进行病毒的分离，对分离到的毒株的σC基因进行扩增、克隆和测序，并与参考毒株σC基因序列进行比对分析，绘制系统进化树。结果表明：分离到一株NDRV毒株，命名为NDRV-GX株。该分离毒株与NDRV代表毒株高度同源，核苷酸相似性为92.5%～100%,氨基酸相似性为94.2%～100%;而与番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus, MDRV)及禽呼肠孤病毒(Avian reovirus, ARV)分离毒株的核苷酸相似性为26.7%～37.2%,氨基酸相似性为27.8%～38.1%;与MDRV、ARV分离毒株处于进化树的不同分支，而与其他NDRV代表毒株处于同一分支。说明该分离毒株为NDRV,与NDRV代表毒株具有相近的遗传演化关系，同属于基因2型。