宏基因组学技术在瘤胃微生物研究中的应用研究进展

反刍动物瘤胃中存在大量微生物，这些瘤胃微生物(rumen microorganisms)是影响反刍动物健康和生产性能的关键因素。宏基因组学技术的发展为研究瘤胃微生物开辟了新的途径和方法。利用宏基因组学技术可研究瘤胃微生物的多样性、瘤胃微生物对宿主生理代谢的影响、瘤胃微生物和宿主的相互作用关系，并且还可以挖掘与代谢相关的新功能基因。笔者综述了宏基因组学技术发展背景，以及该技术在研究反刍动物瘤胃微生物方面的主要应用和不足，包括宿主及其生存环境对瘤胃微生物的影响、日粮中精粗比和饲料添加剂对瘤胃微生物的影响、瘤胃微生物中的抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes, ARGs)、瘤胃微生物对反刍动物产奶性能的影响，并展望了宏基因组学技术在研究瘤胃微生物方面的应用前景，旨在为反刍动物瘤胃微生物的研究提供参考。