藏猪MYL1基因的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 巩兴龙,罗布白珍,韦明邦,肖青青,徐士军,叶幼荣,张健,商鹏.藏猪MYL1基因的克隆及生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2022(2):122-127+132+140-142. |
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作者姓名: | 巩兴龙 罗布白珍 韦明邦 肖青青 徐士军 叶幼荣 张健 商鹏 |
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作者单位: | 1. 西藏农牧学院动物科学学院;2. 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心 |
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摘 要: | 为了克隆藏猪肌球蛋白轻链1 (myosin light chain 1, MYL1)基因编码区序列,并对其进行生物信息学分析,试验根据NCBI网站GenBank中公布的野猪MYL1基因mRNA序列(登录号为NM214374.2)设计特异性引物,以提取的藏猪背最长肌组织总RNA反转录得到的cDNA为模板,对藏猪MYL1基因编码区序列进行PCR扩增,将目的基因进行测序,应用生物信息学分析软件对藏猪MYL1基因编码区序列的同源性、蛋白质的结构和功能(氨基酸组成、一般理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、磷酸化位点、跨膜螺旋结构和信号肽亚细胞定位及蛋白网络互作)进行分析。结果表明:藏猪MYL1基因编码区序列全长为453 bp;藏猪与野猪的亲缘关系最近,与斑马鱼的亲缘关系最远;藏猪MYL1基因编码区序列与野猪、牛、智人、马、绵羊、犬、穴兔、家鼠、鸡和斑马鱼的核苷酸序列相似性分别为100%、92.1%、91.4%、91.2%、91.2%、90.5%、90.3%、89.2%、80.6%和68.2%;藏猪MYL1蛋白存在19种氨基酸,由150个氨基酸组成;藏猪MYL1蛋白分子质量...
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关 键 词: | 藏猪 MYL1基因 克隆 肌肉 生长发育 生物信息学 |
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