山麻鸭SCA-2基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析

为了探究Struthiocalcin-2(SCA-2)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用，试验选择9只产蛋高峰期(30周龄)的健康山麻鸭，采用SMART-RACE方法对山麻鸭SCA-2基因cDNA序列进行克隆，运用生物信息学软件对SCA-2基因编码蛋白质的理化性质、二级和三级结构进行预测及分析，构建SCA-2基因系统进化树；采集试验山麻鸭心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、肌胃、下丘脑、垂体、卵巢，以及输卵管的漏斗部、膨大部、峡部和子宫部共14个组织，每3只做一次混样处理，每个组织共3个重复，提取组织RNA,通过实时荧光定量PCR分析SCA-2基因mRNA在上述组织中的相对表达量。结果表明：SCA-2基因的cDNA全长为726 bp,该基因编码蛋白的分子式为C₈₃₆H₁₂₄₇N₂₂₉O₂₄₇S₈,属于不稳定蛋白，其中丝氨酸(12.6%)、亮氨酸(12.0%)、丙氨酸(10.2%)含量较高；蛋白质的二级结构中，α螺旋占23.35%、β折叠占13.77%、无规卷曲占62.87%,且包...