| 摘 要： | 为了研究繁殖障碍母驴子宫细菌多样性，试验将11头3～5岁成年母驴按健康状况分为健康组(HG组)、子宫炎组(MG组)和屡配不孕组(SG组),分别采集每组的子宫分泌物，提取样本总DNA后对细菌16S rRNA的V3～V4可变区进行PCR扩增，利用Illumina MiSeq PE300平台进行高通量测序。对测序数据进行统计和OTU聚类并绘制稀释曲线，计算Alpha多样性指数(Chao、Ace、Shannon、Simpson、Coverage指数),并基于OTU聚类结果进行物种注释和统计、Beta多样性和菌群相对丰度差异分析。结果表明：共得到有效序列436 487条，其中HG组152 882条，MG组161 781条，SG组121 824条；有效序列长度主要分布在421～460 bp之间，平均序列长度为437 bp,其中HG组约为437 bp, MG组约为438 bp, SG组约为436 bp;根据序列97%相似水平划分得到的OTU数目为511个。SG组和MG组的Ace、Chao指数均高于HG组；Shannon指数以SG组为最高，MG组为最低；Simpson指数以MG组为最高，SG组为最低；...
|
