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| 大片吸虫成虫FG0018表达序列标签序列的电子克隆分析及实验验证 | |
| 引用本文： | 罗洪林,郑小龙,张为宇,覃华,黄维义.大片吸虫成虫FG0018表达序列标签序列的电子克隆分析及实验验证[J].中国预防兽医学报,2005,27(5):418-422. |
| 作者姓名： | 罗洪林 郑小龙 张为宇 覃华 黄维义 |
| 作者单位： | 1. 广西大学,动物科技学院,广西,南宁,530005;西南大学,动物科技学院,重庆,400716 2. 广西大学,动物科技学院,广西,南宁,530005 3. 广西大学,计算机与信息工程学院,广西,南宁,530004 |
| 基金项目： | 中国科学院资助项目，广西自然科学基金 |
| 摘 要： | 用大片吸虫成虫FG0018表达序列标签(Expressed Sequence Tags,ESTs)序列对NCBI数据库进行Blastn比较,采用生物信息学方法,运用网上数据库资源,结合相关生物信息学软件将目标序列进行搜索、处理、拼接、延伸,得到的最后重叠群(contig,命名为FG0018C0N)与肝片吸虫卵壳蛋白B2序列(GenBank:M93025)相似性很高,用DNASTAR、SEQMAN程序和Blast2程序分析FG0018CON,推测其开放阅读框为930bp,编码310个氨基酸,蛋白质的特点及跨膜区预测其编码蛋白可能属于核蛋白,疏水性分析表明其编码一疏水蛋白.FG0018CON基因与肝片吸虫卵壳蛋白基因有100%的相似性,310个氨基酸与之有91%的一致性.经RT-PCR、酶切验证并cDNA测序,结果证明FG0018C0N序列可能是大片吸虫的卵壳蛋白基因. |
| 关 键 词： | 生物信息学 大片吸虫 电子克隆 表达序列标签 |
| 文章编号： | 1008-0589(2005)05-0418-04 |
| 收稿时间： | 2004-04-12 |
| 修稿时间： | 2004年4月12日 |
In silico cloning and verification of expressed sequence tag FG0018 obtained from adult Fasciola gigantica library |
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| LUO Hong-lin,ZHENG Xiao-long,ZHANG Wei-yu,QIN Hua,HUANG Wei-yi.In silico cloning and verification of expressed sequence tag FG0018 obtained from adult Fasciola gigantica library[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2005,27(5):418-422. | |
| Authors: | LUO Hong-lin ZHENG Xiao-long ZHANG Wei-yu QIN Hua HUANG Wei-yi |
| Abstract: | |
| Keywords: | bioinformatics Fasciola gigantica in silico cloning expressed sequence tag |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ | |