基于线粒体COI的DNA条形码在对虾科种类鉴定中的研究 |
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作者姓名: | 易啸 毛 勇 苏永全 |
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作者单位: | 厦门大学海洋与地球学院, 近海海洋环境科学国家重点实验室, 福建 厦门 361102,厦门大学海洋与地球学院, 近海海洋环境科学国家重点实验室, 福建 厦门 361102,厦门大学海洋与地球学院, 近海海洋环境科学国家重点实验室, 福建 厦门 361102,厦门大学海洋与地球学院, 近海海洋环境科学国家重点实验室, 福建 厦门 361102,厦门大学海洋与地球学院, 近海海洋环境科学国家重点实验室, 福建 厦门 361102 |
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基金项目: | 国家虾产业技术体系专项(CARS-48);福建省科技厅重大专项(2016NZ0001-4);厦门海洋经济创新发展示范项目(16CZY009SF05) |
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摘 要: | 对虾科(Penaeidae)包含有26个属,约有200多种对虾,由于同属内的对虾在形态上非常相似,只呈现细微的差别,因此使得只基于形态学对对虾科物种的鉴别非常困难。为确定DNA条形码技术在对虾科物种鉴别的可行性,在本研究中,我们采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(COI)基因研究了32种对虾的核苷酸组成、对虾种间及种内遗传距离,用邻接法(Neighbor-joining)构建32种对虾COI基因序列系统发生树。结果表明,对虾COI基因组成偏倚明显,A+T含量(61.5%)显著高于G+C(38.5%)。基于Kimura双参数模型计算,32个物种的种内平均遗传距离为0.003,种间平均遗传距离(0.468)是种内遗传距离的156倍,符合Hebert提出的种间遗传距离大于或等于10倍种内遗传距离的标准。在系统进化树中,32种对虾中有30种对虾都以较高的置信度聚合成独立的分支。可见,线粒体COI基因作为对虾科DNA条形码在物种的鉴别上具有很好的应用性,可以作为形态学分类系统的必要补充和佐证。
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关 键 词: | 对虾科 DNA条形码 COⅠ基因 鉴别 |
收稿时间: | 2016-12-26 |
修稿时间: | 2016-05-20 |
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