| 初情期母牛下丘脑-垂体-卵巢转录组分析 |
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| 引用本文： | 孙鏖,何芳,浣成,李昊帮,伍佰鑫,胡雄贵,易康乐.初情期母牛下丘脑-垂体-卵巢转录组分析[J].中国兽医学报,2021(2):345-352. |
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| 作者姓名： | 孙鏖 何芳 浣成 李昊帮 伍佰鑫 胡雄贵 易康乐 |
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| 作者单位： | ;1.湖南畜牧兽医研究所 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划资助项目(2018YFD050170);湖南省科学技术厅重大专项资助项目(2017NK1020);湖南省科学技术厅重点研发计划资助项目(2016NK2171)。 |
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| 摘 要： | 通过对3头18月龄安格斯牛下丘脑-垂体-卵巢组织进行转录组测序和生物信息学比较分析,筛选和挖掘与肉牛繁殖活动相关候选基因和信号通路。通过转录组测序,进行表达基因分析、GO和KEGG富集分析以及信号通路筛选。结果显示,共获得61.92 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到6.88 Gb,Q30碱基百分比在92.42%及以上。有15154个基因在所有组织中都有表达,有4780个基因只在2种组织器官中共同表达,有5809个基因只在其中的一个组织器官中表达。下丘脑-垂体-卵巢各组织所表达的基因中,在GO数据库得到注释的分别为2168,2101,13777个,在KEGG数据库中得到注释分别有12477,12446,12176个。在所有KEGG通路中,Notch信号通路(notch signaling pathway)、神经营养因子信号通路(neurotrophin signaling pathway)和血管内皮生长因子信号通路(VEGF signaling pathway)的表达频率最高,说明这些信号通路可能也参与下丘脑-垂体-卵巢轴对母牛繁殖活动的调节。
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| 关 键 词： | RNA-SEQ 母牛 下丘脑 垂体 卵巢 转录组 |
RNA-Seq analysis of hypothalamic-pituitary-ovary(HPO) axis in pubertal cows |
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| SUN Ao,HE Fang,HUAN Cheng,LI Haobang,WU Baixin,HU Xionggui,YI Kangle.RNA-Seq analysis of hypothalamic-pituitary-ovary(HPO) axis in pubertal cows[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2021(2):345-352. |
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| Authors: | SUN Ao HE Fang HUAN Cheng LI Haobang WU Baixin HU Xionggui YI Kangle |
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| Institution: | (Hunan Institute of Animal and Veterinary Science,Changsha 410130,China) |
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