一株园林观赏石榴DFR基因的生物信息学分析

花色素苷是影响植物花色的主要色素,二氢黄酮4-还原酶(DFR)是花色素合成途径的关键酶之一。选择四川成都某公园一株园林观赏石榴,通过克隆获得其DFR基因的cDNA全长序列,进行生物信息学分析。结果显示,该基因含有1个1 026bp的开放阅读框,编码341个氨基酸,推导的DFR蛋白分子量为38.47kD,等电点为6.15,属于NADB-Rossmann超基因家族,不含信号肽和跨膜区,为亲水性蛋白,亚细胞定位细胞质的可能性最高,主要的二级结构元件为α-螺旋和无规则卷曲。系统发育分析结果显示,本研究中石榴DFR蛋白序列与GenBank中石榴聚为一簇,表现出较高的保守性。