| 4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析 |
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| 引用本文： | 胡思科,席瑞珍,任 涛,廖 明. 4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析[J]. 华南农业大学学报, 2013, 34(1): 87-92 |
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| 作者姓名： | 胡思科 席瑞珍 任 涛 廖 明 |
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| 作者单位： | 1 华南农业大学 兽医学院，2 河南理工大学 资源环境学院，;1 华南农业大学 兽医学院，;1 华南农业大学 兽医学院，;1 华南农业大学 兽医学院， |
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| 基金项目： | 教育部创新团队项目（IRT0723）；教育部新世纪优秀人才支持计划（NCET-06-0752）；国家高技术研究发展计划项目（2006AA10A205）；国家科技支撑计划（2006BAD06A16-2）；广东省自然科学基金创新团队项目（5200638）；广东省重大科技计划项目(2005A20401003)；广东省科技计划项目(2006B0152)；广东省教育厅项目（0041101020070521） |
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| 摘 要： | 选取新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)广东分离毒GM株(强毒株)和JM株(弱毒株)以及疫苗毒La-Sota株和标准强毒F48E9株,对其融合蛋白(F)和神经氨酸酶(HN)的编码基因序列进行分析,并利用Insight II软件包(Version 2000)进行F蛋白和HN蛋白C端蛋白单体的空间结构模建.结果显示,4个NDV毒株F蛋白单体分子的空间结构极为相似,大致分为3部分,即头部、茎部和柄部.其中头部结构主要由一些折叠股组成,茎部和柄部主要由螺旋结构组成.比较各毒株F蛋白表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)后发现,该蛋白有5个线性B细胞表位和8个比较保守的抗原决定簇位点,蛋白头部残基的空间位置随毒株的不同而变异较大.GM株与F48E9株存在36个氨基酸残基的差异,JM株和LaSota株存在20个氨基酸残基的差异.研究结果还表明,4个NDV毒株的HN蛋白C端空间结构较保守,由多个折叠股和4段螺旋结构组成,其抗原决定簇位点也高度保守,只有4个氨基酸残基存在差异.
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| 关 键 词： | F蛋白 HN蛋白 模建 表面蛋白溶剂可及表面积(ASA) |
| 收稿时间： | 2012-05-26 |
Construction and Analysis of Three-Dimensional Graphic Model of F and HN Protein Monomer from Four Newcastle Disease Virus Strains |
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| HU Sike,XI Ruizhen,REN Tao and LIAO Ming. Construction and Analysis of Three-Dimensional Graphic Model of F and HN Protein Monomer from Four Newcastle Disease Virus Strains[J]. JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY, 2013, 34(1): 87-92 |
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| Authors: | HU Sike XI Ruizhen REN Tao LIAO Ming |
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| Affiliation: | 1 College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University, 2 College of Resources and Environment, Henan Polytechnic University,;1 College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University,;1 College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University,;1 College of Veterinary Medicine, South China Agricultural University, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | fusion protein hemagglutinin-neuraminidase protein homology modeling solvent-accessible surface area (ASA) |
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