| 谷子、水稻与其野生种基因组转座子比较 |
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| 引用本文： | 李亚军,杨宇琭,孙蓉,李旭凯,李红英. 谷子、水稻与其野生种基因组转座子比较[J]. 中国农业大学学报, 2023, 28(7): 35-45 |
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| 作者姓名： | 李亚军 杨宇琭 孙蓉 李旭凯 李红英 |
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| 作者单位： | 山西农业大学 农学院, 山西 太谷 030801;山西农业大学 生命科学学院, 山西 太谷 030801 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(32070366,32001608)；山西农业大学科技创新基金(2017YJ27) |
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| 摘 要： | 为探究转座子(Transposable elements, TEs)在谷子、水稻驯化过程中的变异，选取谷子(Setaria italica)、狗尾草(Setaria viridis)、栽培稻(Oryza sativa japonica,Oryza sativa indica)、野生稻(Oryza rufipogon,Oryza nivara)的基因组进行转座子注释，统计分析各类转座子在基因组中的插入数及位置，对调控落粒、分蘖、抽穗期和株高等驯化相关基因进行相似性比对。结果表明：在‘晋谷21’突变体(xiaomi)基因组中插入的转座子数目比狗尾草中多4 865个，‘豫谷1号’基因组中插入的转座子数目比狗尾草中少6 286个，而水稻栽培种基因组中转座子数目及所占比例仅为野生种的1/2。在落粒、米色等驯化相关基因中转座子插入在数目及位置上都存在差异，在谷子落粒基因中，谷子基因存在转座子插入，而狗尾草基因中不存在；在谷子米色相关基因中，狗尾草基因中存在转座子插入，谷子基因中不存在。转座子介导驯化相关基因功能变异，历经较长时间的农业生产将适合栽培的农艺性状稳定了下来。
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| 关 键 词： | 转座子 谷子 水稻 栽培 驯化 |
| 收稿时间： | 2022-09-14 |
Genomic transposon comparisons of foxtail millet, rice and their wild species |
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| LI Yajun,YANG Yulu,SUN Rong,LI Xukai,LI Hongying. Genomic transposon comparisons of foxtail millet, rice and their wild species[J]. Journal of China Agricultural University, 2023, 28(7): 35-45 |
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| Authors: | LI Yajun YANG Yulu SUN Rong LI Xukai LI Hongying |
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| Affiliation: | College of Agriculture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China;College of Life Science, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | transposable elements foxtail millet rice cultivate domesticate |
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