| 2011年～2012年G9型猪轮状病毒流行病学调查及VP7基因遗传进化分析 |
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| 引用本文： | 王璐,时洪艳,陈建飞,张鑫,史楠,石达,刘随新,张莎,冯力.2011年～2012年G9型猪轮状病毒流行病学调查及VP7基因遗传进化分析[J].中国预防兽医学报,2013,35(4). |
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| 作者姓名： | 王璐 时洪艳 陈建飞 张鑫 史楠 石达 刘随新 张莎 冯力 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/猪传染病研究室,黑龙江哈尔滨,150001
2. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/猪传染病研究室,黑龙江哈尔滨150001;东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150030 |
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| 基金项目： | 科技部农业科技成果转化资金项目，哈尔滨市科技攻关项目 |
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| 摘 要： | 为分析G9型猪轮状病毒(RV)的遗传变异情况,本研究根据GenBank中VP7序列设计合成一对扩增VP7基因的引物,采用PCR方法对2011年～2012年分离的部分RV VP7基因进行扩增、克隆和序列测定,并进行比对和遗传进化分析.结果表明:531份病料中RV阳性份数为39,阳性率为7.34％;而在检测的121个猪场中,共有23个猪场显示阳性,猪场阳性率为19％.VP7基因全长1 062 bp,含有一个982 bp的开放阅读框,编码326个氨基酸.与参考病毒株VP7全长基因核苷酸比较,同源性为91.5％～99.3％.在31nt、56 nt、75 nt、82 nt、191 nt、215 nt等位置均存在点突变,无插入和缺失.核苷酸系统发育进化树表明:黑龙江省哈尔滨市、桦南、绥化,辽宁省大连市、内蒙古自治区采集病料样品的基因间差异较小,与采集自中国广西、浙江、贵州、北京的病料样品基因相比差异性较大,这表明VP7基因存在地域差异.
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| 关 键 词： | 轮状病毒 VP7基因 G9 遗传变异 |
Epidemiological survey of porcine rotavirus genotype G9 and the genetic variation analysis of VP7 gene |
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