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植物F3'H基因的序列与进化分析
引用本文:胡利宗,张佳慧,王秋霞,李俐俐,王红星.植物F3'H基因的序列与进化分析[J].东北农业大学学报,2015(3):41-49.
作者姓名:胡利宗  张佳慧  王秋霞  李俐俐  王红星
作者单位:周口师范学院生命科学与农学学院,河南 周口,466001
基金项目:周口师范学院2014年高层次人才科研启动经费资助项目
摘    要:类黄酮-3'-羟化酶(F3'H)催化二氢堪非醇生成二氢栎皮黄酮,是花青素合成途径关键酶之一,主要参与决定植物花色、种皮和茎叶着色等性状。利用生物信息学手段对植物类黄酮-3'-羟化酶基因的序列和进化特征进行系统性分析。基因结构分析表明,植物F3'H基因外显子数变异范围为2~7,单子叶植物包括2个外显子,绝大多数双子叶与陆生低等植物具有3或4个外显子。蛋白序列分析显示,植物F3'H蛋白具有13个保守基序,其中10个保守基序与结构域p450相互重叠,其他3个保守基序具有种属特异性。进化分析表明,植物F3'H蛋白具有4个类群,在GroupⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚群中分别检测到4、6、1、7个正选择位点(P0.05),这些位点主要分布在F3'H蛋白不规则卷曲区,说明植物F3'H蛋白主要受控于纯净选择。利用滑动窗口方法发现,5对直系同源基因受到负选择作用,但4对旁系同源基因受到正选择作用,发生适应性进化。试验结果可为进一步研究植物F3'H基因功能及其关键氨基酸位点提供参考。

关 键 词:植物  花青素  类黄酮-3’-羟化酶  序列特征  进化

Sequence and evolutionary analysis of the F3'H genes from the plants
HU Lizong,ZHANG Jiahui,Wang Qiuxiao,LI Lili,WANG Hongxing.Sequence and evolutionary analysis of the F3'H genes from the plants[J].Journal of Northeast Agricultural University,2015(3):41-49.
Authors:HU Lizong  ZHANG Jiahui  Wang Qiuxiao  LI Lili  WANG Hongxing
Institution:HU Lizong;ZHANG Jiahui;Wang Qiuxiao;LI Lili;WANG Hongxing;School of Life Science and Agriculture, Zhoukou Normal University;
Abstract:
Keywords:plant  anthocyanin  flavonoid 3'-hydroxylase  sequence feature  evolution
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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