牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析

旨在探索牛结节性皮肤病病毒（lumpy skin disease virus，LSDV）与宿主细胞的相互作用，采集了具有典型临床症状的牛皮肤病变组织，接种MDBK细胞进行病毒分离，采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞，同时对感染后24 h的MDBK细胞进行转录组学分析，筛选差异表达基因并将其按功能分类，分析它们参与的细胞信号通路。结果显示，LSDV在电镜下呈椭圆形，病毒粒子大小约320 nm×260 nm。转录组分析发现，与未处理组相比，显著差异表达的基因共499个，其中，112个基因上调表达，387个基因下调表达。通过GO和KEGG分析得知，差异表达基因主要富集在从细胞表面传导信号至细胞核内部的MAPK信号通路，其中，参与天然免疫且涉及细胞凋亡的MAP3K1基因表达呈现显著下调，提示病毒感染会影响宿主细胞的迁移与凋亡等过程。显著变化基因包括HIF1A、RORA、LRRK2、AP3B1和ANO6等，分别涉及到调节血管内皮生长因子、炎症反应、细胞增殖分化以及信号转导等功能，除此之外，不饱和脂肪酸及胆汁分泌两个信号通路也发生了显著变化。本研究为进一步深入探究LSDV的致病机制奠定了基础。