乙型脑炎病毒分离株PrM/E基因测序和SA14、SA14-14-2的序列比较 |
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引用本文: | 汤德元,徐健,曾智勇,黄涛,李春燕,李佳蔚.乙型脑炎病毒分离株PrM/E基因测序和SA14、SA14-14-2的序列比较[J].猪业科学,2008,25(12):71-75. |
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作者姓名: | 汤德元 徐健 曾智勇 黄涛 李春燕 李佳蔚 |
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作者单位: | 贵州大学动物科学学院,贵州,贵阳,550025 |
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基金项目: | 贵州省高层次人才科研条件特助经费项目
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摘 要: | 该研究通过RT-PCR扩增乙型脑炎病毒分离株PrM/E基因测序后,将测序结果与GenBanK发表的JEV SA14基因序列和SA14-14-2进行比较分析,结果发现分离株与JEV SA14强毒株的同源性为98.1%,与SA1-14-2株的同源性为97.1%;在477-2477长为2 000 nt决定JEV抗源性的PrM/E区中.分离株与SA14株仅有40个碱基不同,其中12个碱基为错义突变,导致E基因2个氨基酸序列(E135和E232)与SA14的E区两个氨基酸的不同;而分离株与SA14-14-2株有48个碱基不同,导致E基因12个氨基酸序列与SA14-14-2不同.由于确定JEV毒性的10个关键性基酸的位置均在E蛋白上,分离株与SA14强毒株这10个氨基酸的位置完全一致,因此序列的比较结果表明;乙脑病毒分离株为强毒株.由此可以看出基因分析对于病毒毒力的判断具有重要参考意义.
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关 键 词: | 日本乙型脑炎病毒 PrM/E基因克隆 核酸序列 |
收稿时间: | 2008/11/22 0:00:00 |
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